Alterdesk maakt gebruik van firewalls. Firewalls dienen ertoe om het netwerk van de messenger te beschermen tegen ongeautoriseerde toegang van buitenaf.

Inbraakdetectiesystemen bewaken activiteit in de messenger en houden bij wat voor soort handelingen er plaatsvinden. Als er door dit detectiesysteem verdachte activiteit wordt waargenomen, zet het inbraakpreventiesysteem deze persoon in ‘quarantaine’. De verdachte persoon kan dan geen toegang verkrijgen tot de messenger.